Rezerwaty przyrody
Parki krajobrazowe
Cały obszar Nadleśnictwa leży w granicach Parku Krajobrazowego Doliny Sanu
Obszary Natura 2000
Cała powierzchnia Nadleśnictwa została zaliczona do obszaru Natura 2000 PLC180001 „Bieszczady"
Pomniki przyrody
Za pomniki przyrody uznawane są twory przyrody ożywionej i nieożywionej, które oprócz wartości naukowych, przyrodniczych, krajobrazowych, historycznych i kulturowych charakteryzują się indywidualnymi cechami wyróżniającymi je spośród innych tworów natury.
Użytki ekologiczne
Obecnie w zasięgu terytorialnym Nadleśnictwa Stuposiany nie znajduje się żaden istniejący użytek ekologiczny.